Emily Choy war schon als Masterstudentin von der Arktis fasziniert, als sie auf Devon Island, Nunavut, an der Erforschung der Auswirkungen menschlicher Umweltverschmutzung auf die Nahrungsnetze der Hocharktis teilnahm. Seitdem forscht sie in der Arktis und konzentriert sich dabei auf die Auswirkungen des Klimawandels auf Meeresraubtiere wie Belugas, Muränen und Dreizehenmöwen.

Sie promovierte an der University of Manitoba und bei Fisheries and Oceans Canada, wo sie die Rolle der Belugawale als Sentinel-Spezies untersuchte – eine Spezies, die zur Überwachung von Umweltveränderungen in arktischen Meeresökosystemen dienen kann. In Zusammenarbeit mit Gemeinden der Inuvialuit-Siedlungsregion in den Nordwest-Territorien unternahm sie Forschungsreisen in abgelegene Regionen rund um das Ökosystem der Beaufortsee.

2014 wurde sie zum Fellow der Marine Working Group des International Arctic Science Committee ernannt. Sie ist außerdem Fellow der Royal Canadian Geographical Society und erhielt 2020 das L’Oréal Canada For Women in Science Research Excellence Fellowship für ihre Studien über die Auswirkungen des Klimawandels auf Dickschnabelmuren, einen arktischen Seevogel auf Coat Island in der nördlichen Hudson Bay, Nunavut.

Ihre Arbeit beschränkt sich jedoch keineswegs nur auf die Natur. Im Jahr 2014 nahm sie an der Victoria Strait Expedition teil, um nach den verschollenen Schiffen der Franklin-Expedition zu suchen. Als leidenschaftliche Wissenschaftlerin und Mentorin arbeitet sie mit den Earth Rangers zusammen, um Kinder für den Schutz der Tierwelt zu sensibilisieren.